EZLN y EPR obligan a modernizar Semar
Comandos de la Armada recibieron entrenamiento especial de personal naval de EU para desarrollar 17 técnicas de inserción y rastreo, tras el levantamiento zapatista en enero de 1994.
El levantamiento zapatista en enero de 1994 y la aparición de la guerrilla del Ejército Popular Revolucionario (EPR) en junio de 1996, fueron momentos clave que obligaron a la modernización y actualización de la Armada de México, carente entonces de un Cuerpo de Infantería de Marina capaz de enfrentar las amenazas a la seguridad interior.
Mientras el Ejército Mexicano activaba a la Fuerza de Tarea Arcoíris (FTA) en 1994 para contener y aniquilar al movimiento zapatista, la Armada de México hizo lo mismo y creó la Fuerza Tarea del Golfo Sur (FTGS), integrada por 1,650 elementos distribuidos en al menos 10 Estaciones Navales alrededor de las bases del Ejército Zapatista de Liberación Nacional (EZLN).
La Marina actuó a la par de la FTA del Ejército en Chiapas mediante Patrullas compuestas por unos 25 elementos (1 Capitán u Oficial; 1 Maestre o Cabo; 2 conductores, 2 radio operadores, dos rastreadores; 3 Escuadras de Rastreo formadas por 5 hombres cada una), detalla el libro Historia General de la Infantería de Marina Mexicana, Tomo II, ordenado por el alto mando naval y presentado el 14 de noviembre en instalaciones del Centro de Estudios Superiores Navales (CESNAV).